Hoewel neurofeedback niet noodzakelijk, of zelfs niet gebruikelijk, wordt toegepast gedurende de symptomatische periode kan dit wel een onmiddellijk effect hebben op de hoofdpijn. In de toepassing van neurofeedback is het onze ervaring dat iemand met conventionele (spannings-) hoofdpijn deze hoofdpijn met een half uur durende sessie kan laten verdwijnen, of dat in die tijd de intensiteit van de hoofdpijn behoorlijk afneemt. In mindere mate is dit ook het geval bij migraine hoofdpijn. EEG training kan voor een verandering in de fysiologische staat zorgen waardoor de hoofdpijn weg smelt als sneeuw voor de zon. Dit direct optredende voordeel wordt gewaardeerd en is een heel duidelijke indicatie voor de effectiviteit van de training. Echter, het is de bedoeling van neurofeedback de hersenen zo te trainen dat ze een hogere pijndrempel ontwikkelen voor het onstaan van hoofdpijn in het algemeen. Het zal duidelijk zijn dat dit onmiddellijke effect tijdens de neurofeedback gewaardeerd wordt. Daarnaast is het wel een heel duidelijke indicatie dat neurofeedback een doeltreffende behandeling is.
De primaire doelstelling van neurofeedback is echter om de hersenen te training om daardoor een hogere drempel te ontwikkelen voor het ontstaan van hoofdpijn. Dit wil zeggen neurofeedback wordt toegepast om de zelfregulatie van de hersenen te bevorderen; zodat het orgaan minder gevoelig wordt voor de factoren die de hoofdpijn veroorzaken. Dit wordt alleen bereikt met een leerproces waarvoor echt meerdere sessies noodzakelijk zijn. Bij een succesvolle training kan een nagenoeg hoofdpijn vrij bestaan worden bereikt. Veel met neurofeedback getrainde personen rapporteren dan ook een hoofdpijn vrij bestaan gedurende meerdere jaren.
Er bestaan echter ook vormen van hoofdpijn waarbij geen duidelijke verbeteringen verwacht wordt met neurofeedback. Een voorbeeld hiervan is voorhoofdsholte hoofdpijn (ook wel ‘sinus hoofdpijn’ genoemd) waarbij congestie (verstoppingen) de veroorzaker van de hoofdpijn is. Het is dan ook niet zinvol om bij een dergelijke vorm van hoofdpijn neurofeedback als behandeling toe te passen. Hierbij dient natuurlijk de onderliggende oorzaak (b.v. een chronische voorhoofdsholte ontsteking) behandelt te worden. Het is algemeen bekend dat veel vormen van hoofdpijn stress gerelateerd zijn. Nemen we het woord “stress” letterlijk (d.w.z. in de betekenis van ‘belasting’), wat wil zeggen dat de hersenen zich niet in een optimale toestand bevinden, dan wordt of is het organisme, en dus de hersenen, ‘overbelast’. In deze gevallen zorgt het aanleren van een verbeterde zelfregulatie van de hersenen voor een verbeterde stress tolerantie.
Bij de spanningsgerelateerde hoofdpijnen kan het voldoende zijn om een neurofeedback behandeling te ondergaan van een tiental sessies.
Bij migraine hoofdpijnen blijken in de meeste gevallen meer dan tien sessies noodzakelijk. Het is daarbij wel mogelijk om door middel van testonderzoek (tussentijds) na te gaan of er verbetering is opgetreden ten aanzien van de aandacht en concentratie. Aandacht is een van de meest essentiële hersenprocessen. Onderzoek naar de aandacht (als vaardigheid) is daardoor een goede parameter om na te gaan wat de mate van zelfregulatie van de hersenen is. Daarnaast is het mogelijk om een dergelijk onderzoek te doen om het (meest effectieve) trainingsprogramma samen te stellen. Het aantal succesvolle behandelingen bij hoofdpijn ligt erg hoog.